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Table 1.

Q, N and P residues counted per amino acid 80-mers in 20 different P-body components

Protein Q/N* Q N P in Q/N-rich P (in best 80-mer)* Percentage of P (in best 80-mer) P-rich close to Q/N-rich
Lsm4   38   5   33   1   2   2.5   
Pop2   37   29   8   6   12   15.0   yes  
Ccr4   34   11   23   4   10   12.5   yes  
Not1   30   26   4   1   12   15.0   yes  
Edc3   29   19   10   1   5   6.3   
Dhh1   25   25   0   17   19   23.8   yes  
Dcp2   24   13   11   8   20   25.0   yes  
Pat1   23   19   4   18   23   28.8   yes  
Scd6   22   8   14   2   15   18.8   (yes) 
Dcp1   22   4   18   2   4   5.0   
Edc1   22   5   17   10   10   12.5   yes  
Not4   21   11   8   9   10   12.5   yes  
Pan3   20   0   20   6   15   18.8   yes  
Not3   19   9   10   2   13   16.3   (yes) 
Not5   15   8   7   3   12   15.0   
Xrn1   15   5   10   1   24   30.0   (yes) 
Pan2   15   7   8   2   10   12.5   
Lsm1   14   8   6   1   2   2.5   
Not2   11   8   3   7   8   10.0   
Edc2   8   5   3   6   9   11.3   
Protein Q/N* Q N P in Q/N-rich P (in best 80-mer)* Percentage of P (in best 80-mer) P-rich close to Q/N-rich
Lsm4   38   5   33   1   2   2.5   
Pop2   37   29   8   6   12   15.0   yes  
Ccr4   34   11   23   4   10   12.5   yes  
Not1   30   26   4   1   12   15.0   yes  
Edc3   29   19   10   1   5   6.3   
Dhh1   25   25   0   17   19   23.8   yes  
Dcp2   24   13   11   8   20   25.0   yes  
Pat1   23   19   4   18   23   28.8   yes  
Scd6   22   8   14   2   15   18.8   (yes) 
Dcp1   22   4   18   2   4   5.0   
Edc1   22   5   17   10   10   12.5   yes  
Not4   21   11   8   9   10   12.5   yes  
Pan3   20   0   20   6   15   18.8   yes  
Not3   19   9   10   2   13   16.3   (yes) 
Not5   15   8   7   3   12   15.0   
Xrn1   15   5   10   1   24   30.0   (yes) 
Pan2   15   7   8   2   10   12.5   
Lsm1   14   8   6   1   2   2.5   
Not2   11   8   3   7   8   10.0   
Edc2   8   5   3   6   9   11.3   
*

Values indicate the number of residues in the highest scoring 80-mer for that protein

P-rich region near Q/N-rich region scoring <20

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