Skip to Main Content
Table 2.

DNA microarray analyses of muscle related genes

GeneEncoded proteinProbe IDBase signal (ground control)Experimental signal (space-flown)Exp/base log ratio
(A) Muscle related genes (decrease in the space-flown worms)      
myo-3 Myosin A CEG_20137 265.2 213.4 −0.3 
unc-54/myo-4 Myosin B CEG_20207 1843.9 1376.5 −0.5 
myo-2 Myosin C CEG_20321 570.8 188 −1.1 
myo-1/let-75 Myosin D CEG_20622 463.7 210.5 −1.2 
unc-15 Paramyosin CEG_03849 1097.9 964.1 −0.2 
  CEG_18717 1544.7 1198.5 −0.4 
  CEG_22451 2280.4 1822.1 −0.3 
mup-2 Troponin T CEG_21254 927.7 744.1 −0.2 
tnt-2  CEG_13924 994.2 676.8 −0.4 
tnt-3  CEG_02096 180.9 94.2 −0.6 
tnt-4  CEG_12457 266.2 130.4 −1.2 
pat-10, tnc-1 Troponin C CEG_18940 3593.2 3536.8 −0.2 
tnc-2  CEG_17171 566.2 308.6 −0.8 
lev-11 Tropomyosin CEG_00278 837.5 492.6 −0.7 
  CEG_00282 1752.3 1479.2 −0.3 
  CEG_04015 127.2 129.1 0.4 
  CEG_04571 2.4 1.6 −0.8 
  CEG_04677 240 151.5 −0.9 
  CEG_04705 3.4 2.9 −0.4 
  CEG_04706 335.6 315.6 −0.2 
  CEG_22538 2543 1627.8 −0.5 
(B) Transcription factors of myosin heavy chains      
hlh-1 HLH-1 CEG_22040 12.4 11.5 0.4 
ceh-22 CEH-22 CEG_03982 29.5 20.8 −0.6 
  CEG_21974 18.6 9.7 −0.9 
pha-4 PHA-4 CEG_22243 154.3 67.7 −0.8 
  CEG_22244 123.9 73.6 −0.9 
peb-1 PEB-1 CEG_02310 97.1 87.1 −0.4 
  CEG_16296 38.5 25.4 −0.4 
(C) Muscle related genes (no change)      
act-1 Actin CEG_18324 5296.9 4624.1 −0.2 
act-2  CEG_01097 4673.2 4551.7 −0.1 
act-3  CEG_22586 4867 5166.3 0.1 
  CEG_22587 4267.5 4346.3 0 
  CEG_02273 2271.9 2082.7 −0.2 
act-4  CEG_03076 3901.1 3557.2 −0.1 
  CEG_05204 4613 4379.4 −0.1 
nmy-1 Nonmuscle myosin heavy chain CEG_04032 1099.9 1112.3 0 
  CEG_20094 612.7 633.3 0 
nmy-2  CEG_18023 211.6 204.6 0.1 
(D) Protein degradation related genes      
Ubiquitin ligase      
ari-1 ARI-1 CEG_03828 56.2 67.7 0 
  CEG_13039 224.9 261.2 0.2 
skr-1 SKR-1 CEG_22058 832.5 822.8 0 
skr-2 SKR-2 CEG_22056 647.5 841.2 0.2 
skr-3 SKR-3 CEG_16266 785.4 752 0 
skr-4 SKR-4 CEG_16509 400.8 624.1 0.5 
  CEG_16510 845.1 966.9 0.2 
skr-5 SKR-5 CEG_16273 341.9 328.1 −0.1 
skr-6 SKR-6 CEG_16248 5.2 6.3 0.9 
skr-7 SKR-7 CEG_04899 14.5 11.1 −0.3 
skr-8 SKR-8 CEG_00023 31.1 38.6 0.4 
  CEG_01062 40.1 41.8 0.5 
skr-9 SKR-9 CEG_01063 15.5 20.5 0.3 
skr-10 SKR-10 CEG_16699 14.1 10.4 −0.3 
skr-11 SKR-11 CEG_16353 22 23 0 
skr-12 SKR-12 CEG_17470 8.2 6.3 −0.3 
skr-13 SKR-13 CEG_01053 14.1 22.5 0.4 
skr-14 SKR-14 CEG_04912 1 10.4 1.4 
skr-15 SKR-15 CEG_16533 34 31.9 −0.2 
skr-16 SKR-16 CEG_16446 63.4 68.9 0.1 
skr-17 SKR-17 CEG_16549 203 232.1 0.2 
skr-18 SKR-18 CEG_03762 0.7 2.6 1.4 
  CEG_10998 49.5 42.6 −0.1 
  CEG_10999 3.6 13.1 1.6 
  CEG_16424 68.1 86.9 0.3 
skr-19 SKR-19 CEG_22039 232.7 230.1 0 
skr-20 SKR-20 CEG_22041 214.2 198.9 −0.1 
skr-21 SKR-21 CEG_02240 40.3 42.6 −0.3 
  CEG_22051 91.3 89.5 0 
wwp-1 WWP-1 CEG_03315 291.6 257.7 −0.1 
wwp-1  CEG_15444 570.8 602 0.1 
Cathepsin      
asp-1 ASP-1 CEG_11751 6069.1 5242.5 −0.3 
cad-1 cathepsin D     
cpl-1 CPL-1 CEG_00167 35 40.6 0 
  CEG_02271 1893.6 1659.4 −0.2 
cpr-1 CPR-1 CEG_21574 1492.9 880.4 −0.9 
cpr-4 CPR-4 CEG_22239 2779.8 1750.4 −0.6 
cpr-6 CPR-6 CEG_08403 1904.2 1716.9 −0.2 
cpz-1 CPZ-1 CEG_18329 1515.7 1387.4 −0.2 
cpz-2 CPZ-2 CEG_17861 1877.3 1993.6 0 
F32A5.3 Serine carboxypeptidases CEG_19556 306.1 335.5 0 
R07E3.1 Cysteine proteinase Cathepsin F CEG_18041 1786.4 1358.5 −0.3 
Calpain      
clp-1 CLP-1 CEG_17007 502.3 433.8 −0.1 
clp-2 CLP-2 CEG_18817 139.6 144.6 0.2 
clp-3 CLP-3 CEG_03586 9.5 6 0.2 
  CEG_13836 19.8 13.7 0.1 
clp-4 CLP-4 CEG_15434 400.6 287.7 −0.2 
clp-6 CLP-6 CEG_15512 13.5 13.6 0 
clp-7 CLP-7 CEG_01518 239.3 247.1 0.1 
  CEG_15514 163.9 144 0 
GeneEncoded proteinProbe IDBase signal (ground control)Experimental signal (space-flown)Exp/base log ratio
(A) Muscle related genes (decrease in the space-flown worms)      
myo-3 Myosin A CEG_20137 265.2 213.4 −0.3 
unc-54/myo-4 Myosin B CEG_20207 1843.9 1376.5 −0.5 
myo-2 Myosin C CEG_20321 570.8 188 −1.1 
myo-1/let-75 Myosin D CEG_20622 463.7 210.5 −1.2 
unc-15 Paramyosin CEG_03849 1097.9 964.1 −0.2 
  CEG_18717 1544.7 1198.5 −0.4 
  CEG_22451 2280.4 1822.1 −0.3 
mup-2 Troponin T CEG_21254 927.7 744.1 −0.2 
tnt-2  CEG_13924 994.2 676.8 −0.4 
tnt-3  CEG_02096 180.9 94.2 −0.6 
tnt-4  CEG_12457 266.2 130.4 −1.2 
pat-10, tnc-1 Troponin C CEG_18940 3593.2 3536.8 −0.2 
tnc-2  CEG_17171 566.2 308.6 −0.8 
lev-11 Tropomyosin CEG_00278 837.5 492.6 −0.7 
  CEG_00282 1752.3 1479.2 −0.3 
  CEG_04015 127.2 129.1 0.4 
  CEG_04571 2.4 1.6 −0.8 
  CEG_04677 240 151.5 −0.9 
  CEG_04705 3.4 2.9 −0.4 
  CEG_04706 335.6 315.6 −0.2 
  CEG_22538 2543 1627.8 −0.5 
(B) Transcription factors of myosin heavy chains      
hlh-1 HLH-1 CEG_22040 12.4 11.5 0.4 
ceh-22 CEH-22 CEG_03982 29.5 20.8 −0.6 
  CEG_21974 18.6 9.7 −0.9 
pha-4 PHA-4 CEG_22243 154.3 67.7 −0.8 
  CEG_22244 123.9 73.6 −0.9 
peb-1 PEB-1 CEG_02310 97.1 87.1 −0.4 
  CEG_16296 38.5 25.4 −0.4 
(C) Muscle related genes (no change)      
act-1 Actin CEG_18324 5296.9 4624.1 −0.2 
act-2  CEG_01097 4673.2 4551.7 −0.1 
act-3  CEG_22586 4867 5166.3 0.1 
  CEG_22587 4267.5 4346.3 0 
  CEG_02273 2271.9 2082.7 −0.2 
act-4  CEG_03076 3901.1 3557.2 −0.1 
  CEG_05204 4613 4379.4 −0.1 
nmy-1 Nonmuscle myosin heavy chain CEG_04032 1099.9 1112.3 0 
  CEG_20094 612.7 633.3 0 
nmy-2  CEG_18023 211.6 204.6 0.1 
(D) Protein degradation related genes      
Ubiquitin ligase      
ari-1 ARI-1 CEG_03828 56.2 67.7 0 
  CEG_13039 224.9 261.2 0.2 
skr-1 SKR-1 CEG_22058 832.5 822.8 0 
skr-2 SKR-2 CEG_22056 647.5 841.2 0.2 
skr-3 SKR-3 CEG_16266 785.4 752 0 
skr-4 SKR-4 CEG_16509 400.8 624.1 0.5 
  CEG_16510 845.1 966.9 0.2 
skr-5 SKR-5 CEG_16273 341.9 328.1 −0.1 
skr-6 SKR-6 CEG_16248 5.2 6.3 0.9 
skr-7 SKR-7 CEG_04899 14.5 11.1 −0.3 
skr-8 SKR-8 CEG_00023 31.1 38.6 0.4 
  CEG_01062 40.1 41.8 0.5 
skr-9 SKR-9 CEG_01063 15.5 20.5 0.3 
skr-10 SKR-10 CEG_16699 14.1 10.4 −0.3 
skr-11 SKR-11 CEG_16353 22 23 0 
skr-12 SKR-12 CEG_17470 8.2 6.3 −0.3 
skr-13 SKR-13 CEG_01053 14.1 22.5 0.4 
skr-14 SKR-14 CEG_04912 1 10.4 1.4 
skr-15 SKR-15 CEG_16533 34 31.9 −0.2 
skr-16 SKR-16 CEG_16446 63.4 68.9 0.1 
skr-17 SKR-17 CEG_16549 203 232.1 0.2 
skr-18 SKR-18 CEG_03762 0.7 2.6 1.4 
  CEG_10998 49.5 42.6 −0.1 
  CEG_10999 3.6 13.1 1.6 
  CEG_16424 68.1 86.9 0.3 
skr-19 SKR-19 CEG_22039 232.7 230.1 0 
skr-20 SKR-20 CEG_22041 214.2 198.9 −0.1 
skr-21 SKR-21 CEG_02240 40.3 42.6 −0.3 
  CEG_22051 91.3 89.5 0 
wwp-1 WWP-1 CEG_03315 291.6 257.7 −0.1 
wwp-1  CEG_15444 570.8 602 0.1 
Cathepsin      
asp-1 ASP-1 CEG_11751 6069.1 5242.5 −0.3 
cad-1 cathepsin D     
cpl-1 CPL-1 CEG_00167 35 40.6 0 
  CEG_02271 1893.6 1659.4 −0.2 
cpr-1 CPR-1 CEG_21574 1492.9 880.4 −0.9 
cpr-4 CPR-4 CEG_22239 2779.8 1750.4 −0.6 
cpr-6 CPR-6 CEG_08403 1904.2 1716.9 −0.2 
cpz-1 CPZ-1 CEG_18329 1515.7 1387.4 −0.2 
cpz-2 CPZ-2 CEG_17861 1877.3 1993.6 0 
F32A5.3 Serine carboxypeptidases CEG_19556 306.1 335.5 0 
R07E3.1 Cysteine proteinase Cathepsin F CEG_18041 1786.4 1358.5 −0.3 
Calpain      
clp-1 CLP-1 CEG_17007 502.3 433.8 −0.1 
clp-2 CLP-2 CEG_18817 139.6 144.6 0.2 
clp-3 CLP-3 CEG_03586 9.5 6 0.2 
  CEG_13836 19.8 13.7 0.1 
clp-4 CLP-4 CEG_15434 400.6 287.7 −0.2 
clp-6 CLP-6 CEG_15512 13.5 13.6 0 
clp-7 CLP-7 CEG_01518 239.3 247.1 0.1 
  CEG_15514 163.9 144 0 
View Large
Close Modal
This Feature Is Available To Subscribers Only

or Create an Account

Close Modal
Close Modal
This site uses cookies. By continuing to use our website, you are agreeing to our privacy policy.
Accept