Skip to Main Content
Table 2.

DNA microarray analyses of muscle related genes

GeneEncoded proteinProbe IDBase signal (ground control)Experimental signal (space-flown)Exp/base log ratio
(A) Muscle related genes (decrease in the space-flown worms)      
myo-3 Myosin A CEG_20137 265.2 213.4 −0.3 
unc-54/myo-4 Myosin B CEG_20207 1843.9 1376.5 −0.5 
myo-2 Myosin C CEG_20321 570.8 188 −1.1 
myo-1/let-75 Myosin D CEG_20622 463.7 210.5 −1.2 
unc-15 Paramyosin CEG_03849 1097.9 964.1 −0.2 
  CEG_18717 1544.7 1198.5 −0.4 
  CEG_22451 2280.4 1822.1 −0.3 
mup-2 Troponin T CEG_21254 927.7 744.1 −0.2 
tnt-2  CEG_13924 994.2 676.8 −0.4 
tnt-3  CEG_02096 180.9 94.2 −0.6 
tnt-4  CEG_12457 266.2 130.4 −1.2 
pat-10, tnc-1 Troponin C CEG_18940 3593.2 3536.8 −0.2 
tnc-2  CEG_17171 566.2 308.6 −0.8 
lev-11 Tropomyosin CEG_00278 837.5 492.6 −0.7 
  CEG_00282 1752.3 1479.2 −0.3 
  CEG_04015 127.2 129.1 0.4 
  CEG_04571 2.4 1.6 −0.8 
  CEG_04677 240 151.5 −0.9 
  CEG_04705 3.4 2.9 −0.4 
  CEG_04706 335.6 315.6 −0.2 
  CEG_22538 2543 1627.8 −0.5 
(B) Transcription factors of myosin heavy chains      
hlh-1 HLH-1 CEG_22040 12.4 11.5 0.4 
ceh-22 CEH-22 CEG_03982 29.5 20.8 −0.6 
  CEG_21974 18.6 9.7 −0.9 
pha-4 PHA-4 CEG_22243 154.3 67.7 −0.8 
  CEG_22244 123.9 73.6 −0.9 
peb-1 PEB-1 CEG_02310 97.1 87.1 −0.4 
  CEG_16296 38.5 25.4 −0.4 
(C) Muscle related genes (no change)      
act-1 Actin CEG_18324 5296.9 4624.1 −0.2 
act-2  CEG_01097 4673.2 4551.7 −0.1 
act-3  CEG_22586 4867 5166.3 0.1 
  CEG_22587 4267.5 4346.3 
  CEG_02273 2271.9 2082.7 −0.2 
act-4  CEG_03076 3901.1 3557.2 −0.1 
  CEG_05204 4613 4379.4 −0.1 
nmy-1 Nonmuscle myosin heavy chain CEG_04032 1099.9 1112.3 
  CEG_20094 612.7 633.3 
nmy-2  CEG_18023 211.6 204.6 0.1 
(D) Protein degradation related genes      
Ubiquitin ligase      
ari-1 ARI-1 CEG_03828 56.2 67.7 
  CEG_13039 224.9 261.2 0.2 
skr-1 SKR-1 CEG_22058 832.5 822.8 
skr-2 SKR-2 CEG_22056 647.5 841.2 0.2 
skr-3 SKR-3 CEG_16266 785.4 752 
skr-4 SKR-4 CEG_16509 400.8 624.1 0.5 
  CEG_16510 845.1 966.9 0.2 
skr-5 SKR-5 CEG_16273 341.9 328.1 −0.1 
skr-6 SKR-6 CEG_16248 5.2 6.3 0.9 
skr-7 SKR-7 CEG_04899 14.5 11.1 −0.3 
skr-8 SKR-8 CEG_00023 31.1 38.6 0.4 
  CEG_01062 40.1 41.8 0.5 
skr-9 SKR-9 CEG_01063 15.5 20.5 0.3 
skr-10 SKR-10 CEG_16699 14.1 10.4 −0.3 
skr-11 SKR-11 CEG_16353 22 23 
skr-12 SKR-12 CEG_17470 8.2 6.3 −0.3 
skr-13 SKR-13 CEG_01053 14.1 22.5 0.4 
skr-14 SKR-14 CEG_04912 10.4 1.4 
skr-15 SKR-15 CEG_16533 34 31.9 −0.2 
skr-16 SKR-16 CEG_16446 63.4 68.9 0.1 
skr-17 SKR-17 CEG_16549 203 232.1 0.2 
skr-18 SKR-18 CEG_03762 0.7 2.6 1.4 
  CEG_10998 49.5 42.6 −0.1 
  CEG_10999 3.6 13.1 1.6 
  CEG_16424 68.1 86.9 0.3 
skr-19 SKR-19 CEG_22039 232.7 230.1 
skr-20 SKR-20 CEG_22041 214.2 198.9 −0.1 
skr-21 SKR-21 CEG_02240 40.3 42.6 −0.3 
  CEG_22051 91.3 89.5 
wwp-1 WWP-1 CEG_03315 291.6 257.7 −0.1 
wwp-1  CEG_15444 570.8 602 0.1 
Cathepsin      
asp-1 ASP-1 CEG_11751 6069.1 5242.5 −0.3 
cad-1 cathepsin D     
cpl-1 CPL-1 CEG_00167 35 40.6 
  CEG_02271 1893.6 1659.4 −0.2 
cpr-1 CPR-1 CEG_21574 1492.9 880.4 −0.9 
cpr-4 CPR-4 CEG_22239 2779.8 1750.4 −0.6 
cpr-6 CPR-6 CEG_08403 1904.2 1716.9 −0.2 
cpz-1 CPZ-1 CEG_18329 1515.7 1387.4 −0.2 
cpz-2 CPZ-2 CEG_17861 1877.3 1993.6 
F32A5.3 Serine carboxypeptidases CEG_19556 306.1 335.5 
R07E3.1 Cysteine proteinase Cathepsin F CEG_18041 1786.4 1358.5 −0.3 
Calpain      
clp-1 CLP-1 CEG_17007 502.3 433.8 −0.1 
clp-2 CLP-2 CEG_18817 139.6 144.6 0.2 
clp-3 CLP-3 CEG_03586 9.5 0.2 
  CEG_13836 19.8 13.7 0.1 
clp-4 CLP-4 CEG_15434 400.6 287.7 −0.2 
clp-6 CLP-6 CEG_15512 13.5 13.6 
clp-7 CLP-7 CEG_01518 239.3 247.1 0.1 
  CEG_15514 163.9 144 
GeneEncoded proteinProbe IDBase signal (ground control)Experimental signal (space-flown)Exp/base log ratio
(A) Muscle related genes (decrease in the space-flown worms)      
myo-3 Myosin A CEG_20137 265.2 213.4 −0.3 
unc-54/myo-4 Myosin B CEG_20207 1843.9 1376.5 −0.5 
myo-2 Myosin C CEG_20321 570.8 188 −1.1 
myo-1/let-75 Myosin D CEG_20622 463.7 210.5 −1.2 
unc-15 Paramyosin CEG_03849 1097.9 964.1 −0.2 
  CEG_18717 1544.7 1198.5 −0.4 
  CEG_22451 2280.4 1822.1 −0.3 
mup-2 Troponin T CEG_21254 927.7 744.1 −0.2 
tnt-2  CEG_13924 994.2 676.8 −0.4 
tnt-3  CEG_02096 180.9 94.2 −0.6 
tnt-4  CEG_12457 266.2 130.4 −1.2 
pat-10, tnc-1 Troponin C CEG_18940 3593.2 3536.8 −0.2 
tnc-2  CEG_17171 566.2 308.6 −0.8 
lev-11 Tropomyosin CEG_00278 837.5 492.6 −0.7 
  CEG_00282 1752.3 1479.2 −0.3 
  CEG_04015 127.2 129.1 0.4 
  CEG_04571 2.4 1.6 −0.8 
  CEG_04677 240 151.5 −0.9 
  CEG_04705 3.4 2.9 −0.4 
  CEG_04706 335.6 315.6 −0.2 
  CEG_22538 2543 1627.8 −0.5 
(B) Transcription factors of myosin heavy chains      
hlh-1 HLH-1 CEG_22040 12.4 11.5 0.4 
ceh-22 CEH-22 CEG_03982 29.5 20.8 −0.6 
  CEG_21974 18.6 9.7 −0.9 
pha-4 PHA-4 CEG_22243 154.3 67.7 −0.8 
  CEG_22244 123.9 73.6 −0.9 
peb-1 PEB-1 CEG_02310 97.1 87.1 −0.4 
  CEG_16296 38.5 25.4 −0.4 
(C) Muscle related genes (no change)      
act-1 Actin CEG_18324 5296.9 4624.1 −0.2 
act-2  CEG_01097 4673.2 4551.7 −0.1 
act-3  CEG_22586 4867 5166.3 0.1 
  CEG_22587 4267.5 4346.3 
  CEG_02273 2271.9 2082.7 −0.2 
act-4  CEG_03076 3901.1 3557.2 −0.1 
  CEG_05204 4613 4379.4 −0.1 
nmy-1 Nonmuscle myosin heavy chain CEG_04032 1099.9 1112.3 
  CEG_20094 612.7 633.3 
nmy-2  CEG_18023 211.6 204.6 0.1 
(D) Protein degradation related genes      
Ubiquitin ligase      
ari-1 ARI-1 CEG_03828 56.2 67.7 
  CEG_13039 224.9 261.2 0.2 
skr-1 SKR-1 CEG_22058 832.5 822.8 
skr-2 SKR-2 CEG_22056 647.5 841.2 0.2 
skr-3 SKR-3 CEG_16266 785.4 752 
skr-4 SKR-4 CEG_16509 400.8 624.1 0.5 
  CEG_16510 845.1 966.9 0.2 
skr-5 SKR-5 CEG_16273 341.9 328.1 −0.1 
skr-6 SKR-6 CEG_16248 5.2 6.3 0.9 
skr-7 SKR-7 CEG_04899 14.5 11.1 −0.3 
skr-8 SKR-8 CEG_00023 31.1 38.6 0.4 
  CEG_01062 40.1 41.8 0.5 
skr-9 SKR-9 CEG_01063 15.5 20.5 0.3 
skr-10 SKR-10 CEG_16699 14.1 10.4 −0.3 
skr-11 SKR-11 CEG_16353 22 23 
skr-12 SKR-12 CEG_17470 8.2 6.3 −0.3 
skr-13 SKR-13 CEG_01053 14.1 22.5 0.4 
skr-14 SKR-14 CEG_04912 10.4 1.4 
skr-15 SKR-15 CEG_16533 34 31.9 −0.2 
skr-16 SKR-16 CEG_16446 63.4 68.9 0.1 
skr-17 SKR-17 CEG_16549 203 232.1 0.2 
skr-18 SKR-18 CEG_03762 0.7 2.6 1.4 
  CEG_10998 49.5 42.6 −0.1 
  CEG_10999 3.6 13.1 1.6 
  CEG_16424 68.1 86.9 0.3 
skr-19 SKR-19 CEG_22039 232.7 230.1 
skr-20 SKR-20 CEG_22041 214.2 198.9 −0.1 
skr-21 SKR-21 CEG_02240 40.3 42.6 −0.3 
  CEG_22051 91.3 89.5 
wwp-1 WWP-1 CEG_03315 291.6 257.7 −0.1 
wwp-1  CEG_15444 570.8 602 0.1 
Cathepsin      
asp-1 ASP-1 CEG_11751 6069.1 5242.5 −0.3 
cad-1 cathepsin D     
cpl-1 CPL-1 CEG_00167 35 40.6 
  CEG_02271 1893.6 1659.4 −0.2 
cpr-1 CPR-1 CEG_21574 1492.9 880.4 −0.9 
cpr-4 CPR-4 CEG_22239 2779.8 1750.4 −0.6 
cpr-6 CPR-6 CEG_08403 1904.2 1716.9 −0.2 
cpz-1 CPZ-1 CEG_18329 1515.7 1387.4 −0.2 
cpz-2 CPZ-2 CEG_17861 1877.3 1993.6 
F32A5.3 Serine carboxypeptidases CEG_19556 306.1 335.5 
R07E3.1 Cysteine proteinase Cathepsin F CEG_18041 1786.4 1358.5 −0.3 
Calpain      
clp-1 CLP-1 CEG_17007 502.3 433.8 −0.1 
clp-2 CLP-2 CEG_18817 139.6 144.6 0.2 
clp-3 CLP-3 CEG_03586 9.5 0.2 
  CEG_13836 19.8 13.7 0.1 
clp-4 CLP-4 CEG_15434 400.6 287.7 −0.2 
clp-6 CLP-6 CEG_15512 13.5 13.6 
clp-7 CLP-7 CEG_01518 239.3 247.1 0.1 
  CEG_15514 163.9 144 
Close Modal

or Create an Account

Close Modal
Close Modal