Primers used for the quantification of visual pigment transcripts from black bream retinal cDNA by qPCR
| . | Forward primer (5′–3′) . | Reverse primer (5′–3′) . |
|---|---|---|
| SWS1 | TTTGAGCAGGTACATCCCTGAGGGTTTAGG | CCTTGTTTTCGTCTGTCGAGTAGGCGAAGT |
| SWS2A | ATTGGTGGTATGGTCAGCCTGTGGTCTCTT | TGCCGATTTCAGTATGAGGAGCAGCTGTGA |
| SWS2B | TTTGGCGGTATGGTCAGTCTGTGGTCTCTA | GGCCATTTTCAGTGTGATGAGCAGCTGAGT |
| Rh2Aα | TTTTTAGCTTGCGCTGCTCCCCCTCTTTTC | AATCCAGCCGGCAAATGTTGCGTATGGAGT |
| Rh2Aβ | AATATGGCTTGTGCTGCACCCCTCTTTTCG | AATACAGCCGGCAAATGAGGCATATGGGAC |
| LWS | AACAGGTACTGGCCTCATGGTCTGAAGACT | AAAATGCATATCCCGGGTTAGCCGCAGCAA |
| Rh1 | TTTGTCTGCAAGCCCATCAGCAACTTCCGT | TTTTAATTCCCTCTCAGCCCTCTGGGTGGT |
| . | Forward primer (5′–3′) . | Reverse primer (5′–3′) . |
|---|---|---|
| SWS1 | TTTGAGCAGGTACATCCCTGAGGGTTTAGG | CCTTGTTTTCGTCTGTCGAGTAGGCGAAGT |
| SWS2A | ATTGGTGGTATGGTCAGCCTGTGGTCTCTT | TGCCGATTTCAGTATGAGGAGCAGCTGTGA |
| SWS2B | TTTGGCGGTATGGTCAGTCTGTGGTCTCTA | GGCCATTTTCAGTGTGATGAGCAGCTGAGT |
| Rh2Aα | TTTTTAGCTTGCGCTGCTCCCCCTCTTTTC | AATCCAGCCGGCAAATGTTGCGTATGGAGT |
| Rh2Aβ | AATATGGCTTGTGCTGCACCCCTCTTTTCG | AATACAGCCGGCAAATGAGGCATATGGGAC |
| LWS | AACAGGTACTGGCCTCATGGTCTGAAGACT | AAAATGCATATCCCGGGTTAGCCGCAGCAA |
| Rh1 | TTTGTCTGCAAGCCCATCAGCAACTTCCGT | TTTTAATTCCCTCTCAGCCCTCTGGGTGGT |
qPCR, quantitative PCR