Skip to Main Content
Table 2.

Expression of known genes in XEN cells

Affy IDUnigeneGene name or symbolXEN1-3IM8A1-IIM8A1-IIReference
PE genes       
100717_at Mm.2093 Snail 590 660 239 Veltmaat et al., 2000  
95079_at Mm.221403 Pdgfra 1057 1487 1056 Mercola et al., 1990  
104601_at Mm.24096 Thrombomodulin 219 393 199 Healy et al., 1995  
93981_at Mm.154660 tPA, tissue-type plasminogen activator 1641 1893 1191 Marotti et al., 1982  
98482_at Mm.3542 Pthr1 2276 2128 1384 Verheijen et al., 1999a  
98817_at Mm.4913 Follistatin 1869 3475 2990 Feijen et al., 1994  
97160_at Mm.291442 Sparc 5924 7284 7376 Mason et al., 1986  
VE genes       
93950_at Mm.938 Foxa2 (Hnf3β) 552 512 520 Dufort et al., 1998  
160705_at Mm.2390 Cited1 (Msg1) 1208 1032 1651 Dunwoodie et al., 1998  
103949_at Mm.2543 Indian hedgehog (Ihh182 63 156 Becker et al., 1997  
98320_at Mm.42230 Cyp26a1 (P450RAI354 1721 1010 Fujii et al., 1997  
100515_at Mm.5241 Furin 450 327 455 Roebroek et al., 1998  
93460_at Mm.689 Acvr1, Activin A receptor, type 1 93 65 64 Gu et al., 1999  
92713_at Mm.202383 Hnf4 Duncan et al., 1994  
101493_at Mm.358570 Afp, α-fetoprotein Dziadek and Adamson, 1978  
101494_at Mm.358570 Afp, α-fetoprotein Dziadek and Adamson, 1978  
97772_at Mm.4183 Plau, plasminogen activator, urokinase Marotti et al., 1981 
PE and VE genes       
102713_at Mm.247669 Gata4 1091 1196 899 Arceci et al., 1993  
104698_at Mm.329287 Gata6 2468 1973 1086 Koutsourakis et al., 1999  
92487_at Mm.42162 Sox7 981 1339 225 Kanai-Azuma et al., 2002  
92997_g_at Mm.279103 Sox17 1024 1436 1285 Kanai-Azuma et al., 2002  
92996_at Mm.279103 Sox17 1293 1895 1712 Kanai-Azuma et al., 2002  
101396_at Mm.7226 Dab2, Tcf2 (vHnf1111 189 138 Barbacci et al., 1999  
98044_at Mm.240830 Disabled2 206 277 624 Yang et al., 2002  
102258_at Mm.10801 Stra6 465 296 85 Bouillet at al., 1997  
103520_at Mm.282184 Vegfa 112 263 158 Miquerol et al., 1999  
101009_at Mm.358618 Krt2-8 (Endo A) 1358 1962 2737 Hashido et al., 1991  
94270_at Mm.22479 Krt1-18 (Endo B) 1192 2104 3834 Oshima, 1981  
ES and TS cell genes       
103075_at Mm.17031 Pou5f1 (Oct4Palmieri et al., 1994  
161072_at Mm.6047 Nanog Wang et al., 2003  
98414_at Mm.285848 Zfp42 (Rex1) Rogers et al., 1991  
93880_at Mm.200692 Eomes, Eomesodermin Tanaka et al., 1998  
103532_at Mm.200692 Eomes, Eomesodermin Tanaka et al., 1998  
100301_at Mm.235550 Esrrb, Errβ Tanaka et al., 1998  
103239_at Mm.20358 Cdx2 Tanaka et al., 1998  
Affy IDUnigeneGene name or symbolXEN1-3IM8A1-IIM8A1-IIReference
PE genes       
100717_at Mm.2093 Snail 590 660 239 Veltmaat et al., 2000  
95079_at Mm.221403 Pdgfra 1057 1487 1056 Mercola et al., 1990  
104601_at Mm.24096 Thrombomodulin 219 393 199 Healy et al., 1995  
93981_at Mm.154660 tPA, tissue-type plasminogen activator 1641 1893 1191 Marotti et al., 1982  
98482_at Mm.3542 Pthr1 2276 2128 1384 Verheijen et al., 1999a  
98817_at Mm.4913 Follistatin 1869 3475 2990 Feijen et al., 1994  
97160_at Mm.291442 Sparc 5924 7284 7376 Mason et al., 1986  
VE genes       
93950_at Mm.938 Foxa2 (Hnf3β) 552 512 520 Dufort et al., 1998  
160705_at Mm.2390 Cited1 (Msg1) 1208 1032 1651 Dunwoodie et al., 1998  
103949_at Mm.2543 Indian hedgehog (Ihh182 63 156 Becker et al., 1997  
98320_at Mm.42230 Cyp26a1 (P450RAI354 1721 1010 Fujii et al., 1997  
100515_at Mm.5241 Furin 450 327 455 Roebroek et al., 1998  
93460_at Mm.689 Acvr1, Activin A receptor, type 1 93 65 64 Gu et al., 1999  
92713_at Mm.202383 Hnf4 Duncan et al., 1994  
101493_at Mm.358570 Afp, α-fetoprotein Dziadek and Adamson, 1978  
101494_at Mm.358570 Afp, α-fetoprotein Dziadek and Adamson, 1978  
97772_at Mm.4183 Plau, plasminogen activator, urokinase Marotti et al., 1981 
PE and VE genes       
102713_at Mm.247669 Gata4 1091 1196 899 Arceci et al., 1993  
104698_at Mm.329287 Gata6 2468 1973 1086 Koutsourakis et al., 1999  
92487_at Mm.42162 Sox7 981 1339 225 Kanai-Azuma et al., 2002  
92997_g_at Mm.279103 Sox17 1024 1436 1285 Kanai-Azuma et al., 2002  
92996_at Mm.279103 Sox17 1293 1895 1712 Kanai-Azuma et al., 2002  
101396_at Mm.7226 Dab2, Tcf2 (vHnf1111 189 138 Barbacci et al., 1999  
98044_at Mm.240830 Disabled2 206 277 624 Yang et al., 2002  
102258_at Mm.10801 Stra6 465 296 85 Bouillet at al., 1997  
103520_at Mm.282184 Vegfa 112 263 158 Miquerol et al., 1999  
101009_at Mm.358618 Krt2-8 (Endo A) 1358 1962 2737 Hashido et al., 1991  
94270_at Mm.22479 Krt1-18 (Endo B) 1192 2104 3834 Oshima, 1981  
ES and TS cell genes       
103075_at Mm.17031 Pou5f1 (Oct4Palmieri et al., 1994  
161072_at Mm.6047 Nanog Wang et al., 2003  
98414_at Mm.285848 Zfp42 (Rex1) Rogers et al., 1991  
93880_at Mm.200692 Eomes, Eomesodermin Tanaka et al., 1998  
103532_at Mm.200692 Eomes, Eomesodermin Tanaka et al., 1998  
100301_at Mm.235550 Esrrb, Errβ Tanaka et al., 1998  
103239_at Mm.20358 Cdx2 Tanaka et al., 1998  

A subset of genes from expression analysis of XEN cells by Affymetrix profiling (from the mouse U74Av2 Affymetrix array). Data are shown for genes known to be expressed in the VE, PE and other embryonic lineages. The Affy Clone ID, Unigene designation and gene name or symbol are listed. The three XEN samples (XEN1-3, IM8A1-I and IM8A1-II) are described in the text. If a gene is expressed at statistically significant levels (P<0.04),its expression level is indicated by a numerical value; if a gene is not expressed, it is indicated by `A' (absent). A single reference is provided for each gene and others are mentioned in the text. The groupings are a rough guide, as PE expression data for many genes are not available. In addition,many of these genes are expressed at other stages and tissues during development.

Close Modal

or Create an Account

Close Modal
Close Modal